Половодье — характеризуется наибольшей в году водностью, высоким и длительным подъемом уровня, обычно сопровождаемым выходом на пойму. Вызывается главным видом питания (на равнинных реках — снеготаянием, на высокогорных реках – таянием снегов и ледников).
По характеру питания реки, протекающие по территории «Жонгар-Алатауского» ГНПП, относятся преимущественно к ледниково-снеговому типу с хорошо выраженным летним максимумом, который соответствует периоду интенсивного таяния снежников и ледников высокогорья. Максимальные расходы наблюдаются в июне-июле. Начало половодье в конце марта – начале апреля, заканчивается в августе-сентябре.